无 root 权限安装软件的好处
不同用户可以使用不同的软件版本
软件可以随意安装和卸载,不会影响到其他用户
不需要 root 权限
1.使用conda安装
能够用conda安装的软件都能在该链接中搜索到:https://anaconda.org/search?q=
推荐使用conda安装软件的几大原因:
- conda 在安装软件时会自动解决软件的依赖问题;
- 可以在系统安装同一软件的多个版本(如R3.6,R4.1,R4.2),需要安装在不同的虚拟环境中;
- 不需要 root 权限;

1 | # 安装命令示例 |
2.使用编译好的软件
有些软件作者会提供不同平台的编译好的软件,使用者可以下载对应平台的编译好的软件版本使用。
这种程序的特点是不用编译就可以直接使用,下面以安装 vina 为例。
1 | # 查看当前使用系统的 operating-system 和 hardware-platform |
这个链接中有 vina 根据不同平台编译好的软件版本 https://github.com/ccsb-scripps/AutoDock-Vina/releases/,我们可以根据自己使用的操作系统平台下载使用。

1 | # 将软件下载到家目录 |

执行 .profile 文件的原因是因为 .profile 脚本内部将家目录下的 bin 目录加入到 PATH 中,如果你的家目录下没有 .profile 文件可以参考 command not found 中的误删 .profile 创建它。如果你讲可执行程序下载到其他路径,你也可以参考 command not found 将对应的路径添加到 PATH 中。
上文中如果使用 wget 下载 github 中的文件太慢,可以考虑使用 github 代理。参考:github访问出错的解决办法
3.编译安装
如果某些软件需要进行编译安装的,也不一定必须使用 root 权限安装到/usr/local/bin
等需要 root 权限才能操作的目录,可以将其安装到自己的家目录下,这样更安全(因为使用root权限安装的软件拥有root权限,可以在系统里面为所欲为,如果安装了一个来路不明的病毒软件,那么系统就很危险了)。
下面以安装 mwget 为例,mwget 是多线程版本的 wget。
1 | # 进入到家目录,下载软件源码 |

截图信息略去了 make 和 make install 产生的编译信息(太长了……)

执行 .profile 文件的原因是因为 .profile 脚本内部将家目录下的 bin 目录加入到 PATH 中,如果你的家目录下没有 .profile 文件可以参考 command not found 中的误删 .profile 创建它。如果你讲可执行程序下载到其他路径,你也可以参考 command not found 将对应的路径添加到 PATH 中。
上文中如果使用 wget 下载 github 中的文件太慢,可以考虑使用 github 代理。参考:github访问出错的解决办法