conda的安装和卸载

针对 ubuntu20.04
ubuntu20.04 是 “西柚云” 主要使用的操作系统 西柚云官网

安装

1. 下载 conda 的安装脚本（这里使用清华大学的镜像）

   cd ~  # 推荐将 conda 安装在家目录下
   wget -c https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/miniconda/Miniconda3-py39_4.10.3-Linux-x86_64.sh

2. 执行conda安装脚本

   bash Miniconda3-py39_4.10.3-Linux-x86_64.sh

3. 阅读并同意conda的相关协议，不停地回车然后输入yes再回车就安装成功了, 执行脚本后输入的文字的顺序可以参考这个

   回车
   q
   yes
   回车
   yes

4. 为了让安装立即生效，需要执行 .bashrc 脚本，这样会立即进入到 conda 的 base 环境下

   source ~/.bashrc

5. 添加官方源和国内源，这几乎是提速 conda 的唯一方式了。

   # 添加官方源
   conda config --add channels r # R软件包
   conda config --add channels conda-forge # Conda社区维护的不在默认通道中的软件
   conda config --add channels bioconda # 生物信息学类工具
   
   # 添加国内源头 （选其一添加即可）
   # 添加中科大源
   conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
   conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
   conda config --add channels https://mirrors.ustc.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
   conda config --set show_channel_urls yes
   
   # 添加清华大学源（偶尔抽风，此时需要换其他国内源）
   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/pkgs/free/
   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/conda-forge/
   conda config --add channels https://mirrors.tuna.tsinghua.edu.cn/anaconda/cloud/bioconda/
   conda config --set show_channel_urls yes
   
   # 添加阿里云源
   conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/free
   conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/pkgs/main
   conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/conda-forge
   conda config --add channels https://mirrors.aliyun.com/anaconda/cloud/bioconda
   conda config --set show_channel_urls yes

6. 查看 conda 源是否配置成功，可以看出各 channel 的优先级（从上到下优先级依次增加）

   conda config --get channels

   

安装完成！

卸载

conda 的卸载很方便，因为 conda 的安装并不会污染其他系统目录，conda 几乎将所有数据都保存在 miniconda3 目录下

rm -rf .conda
rm -rf .condarc
rm -rf miniconda3

然后再删除 ~/.bashrc 文件中的 conda 初始化添加的语句，也就是删除图示内容

使用文字描述一下这个动作：使用 vim 编辑 .bashrc，将光标移动到要删除的文字后方，输入 i 进入 vim 的编辑模式，然后敲击键盘上的”Backspace” 删除相应文字，文字删除完毕后，按键盘上的 “Esc” 进入 vim 的命令模式，输入 “:wq” 然后回车保存对文件的更改。

vim ~/.bashrc

删完之后执行一下 .bashrc 文件。

source ~/.bashrc

卸载完成！

重装

所谓重装，就是将原来安装的 conda 卸载后再重新安装一次。（参考上述步骤）

补充内容

更换镜像源：

首先删除当前配置的源，然后根据上述教程重新配置源即可

# 删除当前配置的源
conda config --remove-key channels

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